L'église abrite le sanctuaire de Notre-Dame de Bon-Port protectrice d'Antibes Juan-les-Pins et associée à la Corporation des Marins d'Antibes. Chaque année, une fête rappelle et sollicite les protections que la Vierge offre aux marins depuis qu'au XVIe siècle son invocation a chassé la peste bubonique d'Antibes. Traditionnellement, sa statue sculptée dans le tronc d'un figuier est descendue à la cathédrale le 1er jeudi du mois de juillet par le chemin du calvaire, puis remontée le dimanche suivant, portée par les marins pieds nus, selon la coutume. Quant aux premiers pèlerinages, ils remontent aux environs de l'an mille, et le millénaire a été célébré en 1981.